GDが入ってなかったので、入れ方を調べてみたのだが
・yumでgd入れただけではうまくいかず
・php-common再インストールは避けたい

PHP再コンパイルしました。

Shinta’s  s i t e様「PHPでグラフを作ろう！ (gd/JpGraph編)」を参考に必要なものをまず入れる。
./configureのオプションに関しては

上記サイト様他
kishi-r.com様「phpでGDを使う場合のconfigure」
Home@けんどもネット様「PHP のコンパイル –with-gd」

など参考にさせていただきました。
過去にコンパイルしたときの./configureのオプションは
ソースディレクトリがある場所のconfig.nice、もしくはconfig.statusに書いてあります。